Proteomiks Birimi

Hedefler

Proteomiks Birimi, kanser ve bulaşıcı hastalık araştırmaları alanlarında Ar-Ge için proteomik testler ve analizler yürütme konusunda uzmanlaşmıştır.

Büyük ölçekli çalışmalara ağırlık veren birim, proteinlerin yapılarını ve işlevlerini derinlemesine araştırmaktadır.

Birim, protein tespiti, analizi ve sentezi için akredite tanı testleri sağlamaktadır.

Sahadaki uygulama ve etki alanları

Proteomik (proteom) biyobelirteçlerin keşfi, erken tümör teşhisi, prognozu ve tedavisine yardımcı olmaktadır. Kanda bulunan ve hücrelerden ve çevre dokulardan üretilen proteinler, tıpta erken teşhis, prognostik, terapötik ve hatta önleyici kararlarda devrim yaratma potansiyeline sahip kritik biyolojik bilgiler içerir.

AnkaTheraHub’daki Proteomiks Birimi, bulaşıcı hastalıklar bağlamında, özellikle de ortaya çıkan ve yeniden ortaya çıkan viral hastalıklar RNA viral enfeksiyonları alanlarında da çok önemlidir. Ayrıca, antibiyotiklere veya diğer ajanlara karşı çoklu direnç gösteren mikroorganizmaların giderek yaygınlaşmasıyla birlikte, nüksetme durumu antibiyotik öncesi dönemi tehdit etmektedir. Bu nedenle, bulaşıcı hastalıkların etkili kontrolü için yeni seçeneklerin araştırılması giderek daha önemli hale gelmektedir. Proteomiklerin yardımıyla, patojenlerin ve konakçıların işlevi artık proteinlerin, modifikasyonlarının ve etkileşimlerinin izlenmesi için temel olarak genom dizileri ile global olarak değerlendirilebilir. Biyoinformatiğin uygulanması ve yeni teknik başarılar, karmaşık karışımları karakterize etmenin giderek daha mümkün olduğu ve böylece yeni terapötik olanaklara zemin hazırladığı anlamına gelmektedir.

Protein Sequencer: Shimadzu - PPSQ-53A
HPLC: Agilent Technologies - 1290
Capillary Electrophoresis: Sebia - Capillarys Octa 3
LC-MS: Exploris 480 (ORBITRAP)
  • Areas of impact and applications in the field

    Regarding cancer research, synthetic biology seeks to re-design biological systems to perform novel functions in a predictable way. Recent advances in bacterial and mammalian cell engineering include the development of cells that function in biological samples or within the body as minimally invasive diagnostics or theranostics for the real-time regulation of complex pathological conditions. Ex-vivo and in-vivo cell-based biosensors and therapeutics have been developed to target a wide range of diseases including cancer.

    A major milestone in the field of theranostic cell engineering was the 2017 FDA approval of tisagenlecleucel, the first gene therapy to be approved in the USA. Considering the above, this facility will work on preclinical applications of mammalian sensing and drug delivery platforms as well as underlying biological designs that could lead to new classes of cell diagnostics and therapeutics.

    In the context of infectious diseases, there is a growing need for novel, specific, sensitive, and effective diagnostic and treatment procedures. Synthetic systems and devices are evolving into strong tools for treating human infections. The advancement of synthetic biology provides platforms for detecting and preventing infectious diseases that are efficient, accurate, and cost-effective.

Hizmetler

  • LC-MS/MS method-based protein identification
  • Complex Proteome Analysis - Relative Quantification (LFQ-TMT)
  • Intact protein analysis (MW Determination using Mass Spectrometry)
  • Targeted Proteomic Analysis (PRM Methodology)
  • Special Calibration/Test
  • List of Equipments

    Equipment name
    Make
    Model
    Photo
    Equipment name:
    Protein sequencer
    Make:
    Shimadzu
    Model:
    PPSQ-53A
    Equipment name:
    Lyophilizator / Freeze Dryer
    Make:
    Labogene
    Model:
    Coolsafe Touch 95-80
    Equipment name:
    HPLC
    Make:
    Agilent Technologies
    Model:
    1290
    Equipment name:
    Refrigerator (+4C)
    Make:
    Frimed
    Model:
    AF140
    Equipment name:
    LC-MS
    Make:
    Thermo Scientific
    Model:
    Exploris 480 (ORBITRAP)
    Equipment name:
    Capillary Electrophoresis
    Make:
    Sebia
    Model:
    Capillarys Octa 3

    Ekip

    Dr. Burak V. Kabasakal
    Türk Hızlandırıcı ve Işınım Laboratuvarı (TARLA)
    Birim Lideri
    research, development, R&D, proteomics, laboratory, healthcare, theranostics products, healthcare industry, innovation, health, diagnosis
    AnkaTheraHub, kanser ve bulaşıcı hastalıklar alanında yüksek katma değerli ve yüksek teknolojili yenilikçi teranostik ürünler üretmeleri amacıyla KOBİ'lere odaklanarak Türkiye'deki sağlık sektörünün Ar-Ge kapasitesini desteklemeye kendini adamıştır.